Longue de 475 km, la rivière Winisk prend sa source dans le lac Wunnummin, dans le district de Kenora, dans le Nord de l'Ontario. Elle coule vers l'est et le nord-est et se jette dans la Baie d'Hudson. Son nom provient d'un mot cri signifiant « marmotte ». Elle draine une région de 67 300 km2, dont la majeure partie est inhabitée.